Nel primo episodio i protagonisti liberano i 13 fantasmi. Negli episodi successivi rinchiudono i personaggi nello scrigno. Dalla serie "Mystery Incorporated" si può capire che Vincent Van Ghoul, dopo la serie, ha proseguito la sua carriera d'attore, mentre Flim-Flam è stato arrestato e condannato a ben 25 anni. Mentre Scrappy Doo, pur rimanendo molto affezionato a suo zio, si allontana dalla banda. Nella serie vengono rinchiusi solo 12 Fantasmi nello scrigno a differenza di 13. La serie risulta infatti priva di un vero finale.